实验室建设设计工作一般分为初步设计和施工图设计两个阶段。对于大型实验室工程设计在初步设计之前进行方案设计，小型建筑工程设计可以用方案设计代替初步设计。
方案设计
根据实验室建设的任务和基本要求，在前期准备工作的基础上进行建筑方案设计。 一般要求设计方案满足实验室的功能要求，符合城市建设规划。 设计方案经专家论证、评审、比较后，提出实施方案或综合几种方案的优点进行进一步修改，以获得更满意的设计方案。
在这个环节中，实验室要充分考虑提供更成熟的功能需求。忌讳边建设边修改，尤其是设计实验室功能的改变。 因为在实验室工作人员看来，很多变化只是一个房间的变化，或者一个水龙头位置的变化，但对于设计师来说，可能是一个多学科的设计变化，动辄上百张图纸。 有可能重新铺管、拆墙等，直接带来人力、时间、物力的损失。 因此，实验室的功能规划和布局必须慎重。
初步计划
在方案设计的基础上，进一步进行具体实施方案的初步设计，这是施工图设计的主要依据。 其内容主要包括：设计依据、设计理念、总体规划、主体建设工程方案设计、主要材料用量、工艺设计、主要设备造型、三废处理、生活组织及劳动定额、相关技术经济指标、抗震性能和 人防、建设顺序和时限、总预算等。
在这个环节中，实验室要重点关注设计图纸中是否体现了一些关键点，如各房间的配电容量、个别接地的处理、通风管道的设计等。
施工设计
根据批复的初步设计文件，对各相关专业项目的规模和局部详细设计进行详细指导，指导现场施工安装和设备材料准备，并据此编制详细的项目概算。 设计工作的最后阶段，主要内容包括：总体规划、建筑、结构。 给排水、电气、供暖通风等相关专业设备系统设计； 准确详细地确定其位置净距、坐标、标高、结构形式、节点明细、材料方法、尺寸、坡向、材料类型、设备选型标准图纸规格或索引号、施工安装技术要求、特殊工程检验方法 零件等
实验室应重点关注管道、电气、供暖和通风等专业系统的具体位置和材料选择。
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