补风型通风柜的设计原理决定了其主要优点：节能减排，能够大大减少实验室的排风量，从而降低了实验室的能耗；环境舒适度高，实验室温湿度容易控制；而主要缺点是当一侧发生变化时，不容易协调补风、车窗进风和排气之间的关系。因此，通风柜芯的负压保护功能紊乱，有毒有害气体反而泄漏。
对于外部补风式通风柜，尝试在通风柜玻璃门上设置补风出口，使气流从上到下，通过操作面进入通风柜内部，然后由风管抽出，使气流非常顺畅，排气效果好。然而，人们在空气补充下工作是不舒服的。室外的温度和湿度经常使实验者的头皮爆炸，因此许多实验者减少了在通风柜前的实验时间
对于内置式通风柜，送风口设置在通风柜内，大部分设置在通风柜的前额。这样，气流从内部流向底部。实验人员的舒适度比外部空气供应要好得多，但很容易将有毒有害气体吹出窗外并逃逸。因此，虽然内部补风式通风柜有效降低了能源效率，但安全性则需要更好的技术手段来保证。
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